La nef possède quatre arches. Les bas-côtés possèdent des matronei. Les quatre chapelles, correspondant aux deuxième et quatrième arches, sont une addition ultérieure. Sous l'abside, décorée d'une fresque du xvie siècle, est placé le maître-autel datant de 1383 et recueillant les restes de saint Ennode et de saint Eleucade. Le chœur comporte des fragments d'une mosaïque représentant les Labeurs des mois et des thèmes mythologiques.
La crypte, possédant une nef et deux bas-côtés, est située sous l'autel.
Un Christ en bois sculpté et recouvert d'une feuille d'argent y est conservé. Sa statique plaide en faveur d'un Christ triomphant de l'art préroman